PhD Genomics: Van Genoom naar Diagnose met WGS, Antwerpen

Bepaal mee de toekomst - Universiteit Antwerpen De Universiteit Antwerpen is een dynamische, toekomstgerichte Europese universiteit. We bieden vernieuwend academisch onderwijs aan meer dan 20000 studenten, verrichten baanbrekend wetenschappelijk onderzoek en spelen een belangrijke dienstverlenende rol in de maatschappij. We zijn een van de grootste, meest internationale en innovatieve werkgevers van de regio. Met meer dan 6000 medewerkers uit 100 verschillende landen bouwen we dagelijks aan de wereld van morgen. Door wetenschappelijk toponderzoek verleggen we grenzen en geven we de richting aan. De richting van de toekomst. En die kan jij mee bepalen.Voor een whole genome sequencing project is het Centrum voor Medische Genetica binnen de Faculteit Geneeskunde en Gezondheidswetenschappen van de Universiteit Antwerpen op zoek naar een voltijdse (100%) doctoraatsbursaal in het domein van“Van genoom naar diagnose: toepassing en translatie van whole genome sequencing bij zeldzame aandoeningen”Bouw mee aan de whole genome sequencing diagnostiek van de toekomst Next generation sequencing heeft de voorbije tien jaar een indrukwekkende evolutie doorgemaakt. Wat begon met gerichte genpaneltesting, groeide uit tot exoomsequencing en uiteindelijk whole genome sequencing. Dankzij steeds snellere, nauwkeurigere en betaalbaardere technologieën komt nu ook short read en

long-read whole genome sequencing (sr/lrWGS) binnen handbereik van de klinische diagnostiek. Deze technologie opent nieuwe mogelijkheden om de genetische oorzaak van zeldzame aandoeningen op te sporen, ook wanneer klassieke diagnostische technieken geen antwoord bieden. Tegelijk brengt lrWGS nieuwe uitdagingen met zich mee, vooral op het vlak van bio-informatica, data-analyse en klinische interpretatie.Binnen dit doctoraat krijg je de kans om bij te dragen aan de klinische toepassing en translatie van whole genome sequencing voor de diagnostiek van zeldzame aandoeningen. Je werkt met sr/lrWGS-data en ontwikkelt mee aan innovatieve analysemethoden die de genetische diagnostiek naar een hoger niveau tillen. Je onderzoek richt zich onder meer op:het identificeren van pathogene structurele variaties; het opsporen van nieuwe ziekteveroorzakende tandem repeats; het integreren van episignatures in het diagnostisch algoritme; het detecteren en interpreteren van niet-coderende pathogene varianten. Zo draag je bij aan een toekomst waarin meer patiënten met een zeldzame aandoening sneller en nauwkeuriger een diagnose krijgen.Het project zal worden uitgevoerd op CMG Antwerpen, dat geaffilieerd is met zowel de Universiteit Antwerpen en het Universitair Ziekenhuis Antwerpen. Het centrum heeft uitgebreide expertise en infrastructuur op het gebied van klinisch, moleculair en pathofysiologisch onderzoek naar erfelijke aandoeningen, waaronder hart- en vaatziekten, gehoorverlies, kanker, botaandoeningen en verstandelijke beperkingen. Binnen deze setting leiden de onderzoeksteams van prof. dr. Loeys en prof. dr. Meuwissen de projecten die gericht zijn op cardiovasculaire en neurologische ontwikkelingsaandoeningen. Het PhD project zal mee begeleid worden door dr. Dale Annear en Prof. Josephina Meester, die beiden een sterke achtergrond hebben in bio-informatica analyse van genomische data sets.Functie Je werkt actief aan de voorbereiding van een PhD thesis in state-of-the-art genomisch onderzoek, waarbij je kwalitatieve wetenschappelijke artikelen die verband houden met het onderzoeksproject publiceert. Je presenteert je werk op nationale en internationale congressen en symposia. ProfielJe behaalde een masterdiploma in Bio(medische) wetenschappen, Biochemie, Biotechnologie, Bio-ingenieurswetenschappen of Bio-informatica, of je behaalt het diploma uiterlijk op het moment van aanstelling. Je komt in aanmerking om een doctoraatsbeurs van het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek (FWO) aan te vragen.Je onderzoekskwaliteiten sluiten aan bij het facultaire en universitaire onderzoeksbeleid . Je kan uitstekende studieresultaten voorleggen. Je hebt ambitie, integriteit en een sterk oog voor kwaliteit, alsook een positieve ingesteldheid. Je bent een echte teamspeler met goede communicatieve vaardigheden.Je bent vlot in geschreven en gesproken Engels. Project-specifieke vereiste vaardigheden Je hebt een sterke affiniteit met en expertise in bio-informatica-analyses, of een aantoonbare sterke interesse in dit vakgebied. Aanbod We bieden een doctoraatsbeurs aan vooréén jaar. Na een positieve evaluatie en afhankelijk van de beschikbare financiering, wordt de beurs verlengd met drie bijkomende jarenDe voorziene startdatum is 15/09/2026 of zo spoedig mogelijk nadien. Je maandelijkse beurs wordt berekend volgens de beursbedragen voor doctoraatsbursalen. Je krijgt ecocheques en een fietsvergoeding of terugbetaling van je woon-werkverkeer met het openbaar vervoer. Je krijgt als doctoraatsonderzoeker toegang tot een breed en gevarieerd opleidingsaanbod en opleidingskrediet via de Antwerp Doctoral School.Je werkt grotendeels op CMG Antwerpen, in een dynamische en stimulerende werkomgeving. Lees hier meer over werken bij de Universiteit Antwerpen. Solliciteren? Je kan tot en met 18 juni 2026 voor deze vacature solliciteren via het online sollicitatieplatform van de Universiteit Antwerpen. Klik op de knop‘Solliciteren’ en vervolledig het online sollicitatieformulier. Voegvolgende bijlages toe:Motivatiebrief Academisch CV (inclusief onderscheidingen, academische graden, vaardigheden, eerdere mobiliteit, publicaties,…) De selectiecommissie bekijkt zo snel mogelijk na de sollicitatiedeadline alle sollicitaties. Zodra er een beslissing genomen is, brengen we je op de hoogte. Als je na de preselectie nog steeds in aanmerking komt, word je geïnformeerd over de eventuele volgende stap(pen) in de selectieprocedure.Bij vragen over het online sollicitatieformulier kan je de Frequently Asked Questions raadplegen of mailen naar . Bij inhoudelijke vragen over de functie kan je contact opnemen met Dr. Bart Loeys ( ) of Prof. Dr. Marije Meuwissen ( )De Europese Commissie bekroonde het HR-beleid van de Universiteit Antwerpen met de‘ HR Excellence in Research Award ’. We zijn een duurzame, gezinsvriendelijke organisatie die maximaal in de groei van medewerkers investeert. We stimuleren diversiteit en hechten veel belang aan een inclusieve werkomgeving met gelijke kansen - ongeacht gender, functiebeperking, afkomst, levensbeschouwing, seksuele oriëntatie of leeftijd. Wij moedigen mensen met een diverse achtergrond en diverse eigenschappen aan om te solliciteren.

#J-18808-Ljbffr